Выплата страховой суммы за непоставленный товар

Здравствуйте. Подскажите ответ на такой вопрос. Мы государственное автономное учреждение. В 2014 году по гос. контракту нам поставляли товар согласно графику через транспортную организацию. Но последняя поставка за ноябрь месяц до нас не дошла. При сверке с поставщиком выяснили, что товар потерялся в транспортной организации. Не по вине поставщика получается. Транспортная организация готова нам возместить сумму этого товара (она небольшая в пределах 2 тысяч рублей). Поставщик просит нас затем как бы оплатить этой суммой их товар. Можно ли так сделать, и какими проводками в бюджетном учёте это отразить? Получается поставщику надо закрыть контракт, они товар отправляли. И транспортная организация согласна, что это их вина, что не поставили товар нам. А как нам правильно поступить?